Lance Sterling (doppiato da Will Smith) è un super agente segreto, affascinante e impeccabile sul lavoro. Walter Beckett (doppiato da Tom Holland) è un giovane e brillante scienziato che si occupa di creare armi segrete e incredibili gadget. Un evento fortuito unirà i due improbabili eroi, che dovranno imparare a contare l'uno sull'altro per la più importante delle missioni: salvare il pianeta.